Auch im Allgäu gibt es ein paar kleinere Neuerungen zu verzeichnen:

- Der zweistündliche RE Ulm-Kempten-Immenstadt-Lindau/Oberstdorf verkehrt nicht mehr mit Zugteil nach Lindau. Stattdessen gibt es 35 Minuten später eine neue Verbindung Kempten-Hergatz mit langer Wende in Hergatz. Es besteht Anschluss an den RE München-Memmigen-Lindau-Reutin

- Die zweistündliche RB Augsburg-Kempten-Pfronten wird jetzt als RE geführt.

- Der stündliche RE Türkheim-Bad Wörishofen fährt zur ungeraden Stunde 20 Minuten früher, in der Gegenrichtung zur geraden Stunde 20 Minuten später.

- Die Fahrzeit des EC München-Zürich verkürzt sich zwischen München und Buchloe um 7 Minuten. Fahrzeiten des Regionalverkehrs ändern sich im Minutenbereich, da die S4 neu viertelstündlich bis Geltendorf fährt.

- Zusätzliche, stündliche RB-Linie Augsburg-Marktoberdorf mit Halt an allen Stationen. Abfahrt in Augsburg zur Minute 18, direkt hinter den RE Augsburg-Pfronten bzw. -Oberstdorf

- Die stündliche RB Ulm-Memmingen fährt 30 Minuten versetzt und wird nach Buxheim verlängert, teilweise mit Zugteil nach Weißenhorn. Die RB Ulm-Weißenhorn wird ebenfalls um 30 Minuten gedreht und bekommt in der HVZ einen Zugteil nach Illertissen.

- Die zweistündliche RB Memmingen-Sigmaringen wird auf den Laufweg Leutkirch-Aulendorf gekürzt. Die zweistündliche RB Aulendorf-Kißlegg wird nach Wangen verlängert, im Gegenzug entfällt die zweistündliche RB Kißlegg-Lindau

- Die enstandenen Lücken zwischen Buxheim und Leutkirch bzw. Wangen und Hergatz füllt ein neuer, zweistündlicher RE Memmingen-Lindau-Reutin

- Nicht mehr Allgäu, aber trotzdem nett: die stündliche RB Augsburg-Langenneufnach